全基因组重测序-武汉贝科新肽科技公司(图)
α-淀粉酶基因amy11基因座是目前大麦研究中有经济价值的基因位点,它编码的淀粉酶将多糖淀粉裂解成短链形式,影响大麦的长势和生存能力以及栽培品种的淀粉分解(酿酒)能力。研究团队用PGGB构建局部泛基因组图谱,通过聚类分析,发现基于结构特征进行的聚类结果与amy11拷贝数存在显著的相关性。这结果为针对amy11位点的选择性育种以及amy11单倍型的培育提供了基础。1.单倍型T2T基因组组装,主要针对高杂合二倍体及多倍体植物开发新的解决方案,主要采用二代高通量和三代ONT结合单独开发的生信系统进行组装。主要应用于指导下游分子育种、subgenome比较分析、多倍体起源与进化。2.泛基因组研究,利用二代高通量、三代ONT测序和生物信息学分析,对不同但又相互关联的个体材料进行较高深度测序和组装,构建泛基因组图谱,该物种完整的遗传信息。为研究物种遗传多样性、作物改良、物种进化及生态适应提供研究基础。PtoGntK与PtoRAP2.12调控植物生长QTL作图和GWAS分析发现PtoGntK与植物生长显著相关,其启动子区域SNPs位于可及区域。PtoGntK的过表达促进生长,而敲除导致生长迟缓。酵母单杂交等实验证实PtORAP2.12结合PtoGntK启动子的去化可及性区域,其表达,刺激植物生长。结论本研究揭示DNA化通过调控染色质可及性影响基因表达的机制,全基因组重测序,即DNA去化改变染色质可及性,影响转录因子PtoRAP2.12与PtoGntK启动子结合来调控转录、影响植物生长,为理解木本植物表观遗传调控机制及分子设计改良提供理论基础。全基因组重测序-武汉贝科新肽科技公司(图)由武汉贝科新肽科技有限公司提供。武汉贝科新肽科技有限公司坚持“以人为本”的企业理念,拥有一支高素质的员工队伍,力求提供更好的产品和服务回馈社会,并欢迎广大新老客户光临惠顾,真诚合作、共创美好未来。贝科新肽——您可信赖的朋友,公司地址:武汉市洪山区雄楚大道339号林业局林木种苗管理总站科技楼6楼606,联系人:夏先生。)